国务院第一次全国污染源普查领导小组办公室派出由环境保护部环境监察局副局长、全国污染源普查办副主任陈善荣为组长的国家核查组于2008年11月4日至8日对我区各市县10月下旬上报的污染源普查数据进行了质量核查，按行业、分指标比对分析了普查数据与环统数据，利用高级查询功能筛选出一批需要核实的企业名单，并抽查了南宁市兴宁区数据录入情况。
核查主要是为加强第一次全国污染源普查数据录入、汇总审核工作，保证第二阶段数据上报质量而开展。核查的主要内容包括检查样本区数据录入质量及数据汇总审核情况，了解各地数据录入、汇总及审核工作开展情况，开展数据审核评估和对比分析，评估普查数据的合理性及真实性。核查组肯定了我区污染源普查工作取得的成绩，但同时也指出我区污染源普查数据质量还存在较多问题，要求我区加强技术力量，克服松懈思想，切实抓好辖区普查数据审核、修正工作，确保普查数据没有明显的错误，全面提高全区污染源普查数据质量，顺利完成普查数据终报工作。